能準確挖掘地方豬重要基因的育種液相芯片誕生
種業振興,良種先行。優良的豬種是現代化高效養豬的前提和核心。
《中國科學報》記者4月16日從中國科學院亞熱帶農業生態研究所獲悉,中國工程院院士、亞熱帶生態所研究員印遇龍科研團隊牽頭,聯合湖南農業大學與華智生物技術有限公司科研團隊,利用cGPS靶向測序技術合作開發了首款適用于湘豬等地方豬的64K cGPS育種液相芯片。
湘豬64K cGPS液相育種芯片SNP標記在染色體上的分布圖。受訪者 供圖
湖南擁有豐富的地方豬遺傳資源,包括寧鄉豬、沙子嶺豬、大圍子豬等多個品種,因適應性強、耐粗飼和肉質風味獨特深受廣大養殖戶和消費者喜愛。
當前,地方豬品種的種質資源保護和良種選育工作較為落后,導致地方豬繁殖、肉質、抗逆性等優良性狀退化,且地方豬生長速度慢,嚴重影響經濟效益。利用高效的現代分子育種技術和工具,多維度、多層次開發和利用地方豬優異種質資源是振興湘豬等地方豬產業的重要舉措。
64K cGPS液相芯片的位點多態性好、基因組分布均勻。研究團隊通過選擇多樣性豐富的湖南地方豬種和廣東地方豬種,基于其全基因組重測序數據,篩選到湖南、廣東地方豬種中高多態位點64K,均勻覆蓋全基因組。結果顯示,利用該芯片在豬早期進行分子標記輔助育種選擇,能很好地提高生豬育種效率。
該芯片還有品種特異性位點及功能位點豐富的特點,包含寧鄉豬和廣東豬等品種特異性位點,囊括背膘厚、肉質等功能分子標記位點256個,可進行背膘厚、肉質等重要性狀基因的挖掘利用,產品技術參數優良;經樣本測試,該產品位點檢出率高,平均檢出率為99.23%。產品穩定性好,重復樣本基因型平均一致率為99.31 %,整體性能優良。
印遇龍表示,該芯片的廣泛應用,將有效提高地方豬重要性狀遺傳基礎解析和優異基因資源挖掘的準確性,提升生豬核心種源自主選育的效率,引領現代特色優質生豬種業發展,對推動生豬產業高質量發展具有重要戰略意義。
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